Essa nascente povoação com grande força de vontade, não obstante às contrariedades e opressões que se antepunham ao seu desenvolvimento, foi tomando incremento. Mais tarde foi transferida para terra firme, localizada na margem esquerda do rio Itiberê, então conhecido como Taguaré. Os anos passaram e Paranaguá se desenvolveu, transformando-se em importante cidade.

Histórico
Ainda no século XVI, quando da chegada dos primeiros colonizadores, a baía de Paranaguá exerceu importante papel, sob o prisma geográfico: sua entrada correspondia ao limite da Segunda parte da capitania de São Vicente, com 46 léguas até a costa. Começava em Bertioga, no litoral paulista, estendendo-se até a altura da Ilha do Mel, na costa paranaense. Em 1549, o alemão Hans Staden, que aportou no Brasil a bordo de navios portugueses e aqui permaneceu, refém dos indígenas, durante bom tempo, constatou que Superagüi abrigou o primeiro núcleo de lusos. Foi esse núcleo povoador que depois se radicou na Cotinga.

Até meados do século XVI a principal atividade econômica, além do plantio de pequenas áreas, foi o tráfego de bugres nativos. Em 1646 foi erguido do Pelourinho, símbolo da justiça, e em 4 de maio de 1647 Gabriel de Lara, bandeirante que exerceu importante papel no desenvolvimento de Paranaguá, requereu ao rei a criação da Vila de Nossa Senhora de Paranaguá, o que foi deferido por Carta Régia de 29 de julho de 1648. Meses depois, em 26 de dezembro, procedeu, como capitão povoador, à eleição das justiças, dando-lhes posse em 7 de janeiro de 1649, quando se instalou a Câmara Municipal da nova vila.

Em 1688, com aproximadamente 1.500 habitantes, Paranaguá foi assolada por uma epidemia de cólera que em pouco tempo reduziu para um terço a população. No reinado de D. José I, em 1767 tem-se início a construção da Fortaleza de Nossa Sra. dos Prazeres, por expressar determinação do Marquês de Pombal, tendo sido um posto avançado para defesa contra os ataques de piratas.

A necessidade da criação de uma província que separasse o atual Paraná de São Paulo foi manifestada em 6 de julho de 1811, quando a Câmara Municipal tomou a iniciativa de representar junto ao príncipe regente, solicitando a emancipação da Comarca e a criação de nova capitania, em virtude da grande distância de São Paulo. Baseava sua petição no estado de indigência e miséria em que vivia a comarca e por total ausência de governo. Somente em 1821 Paranaguá foi emancipada recebendo o título de Cidade, tendo na época cerca de 2.000 habitantes e 400 edificações.